Les missions du consultant fonctionnel SI s'organisent en plusieurs phases structurées qui couvrent l'ensemble du cycle de vie d'un projet de système d'information. La première phase, le cadrage, consiste à comprendre le contexte de l'entreprise cliente, ses enjeux stratégiques, son organisation et ses processus existants. Le consultant mène des entretiens avec les différentes parties prenantes (direction générale, directions métier, utilisateurs clés) pour recueillir et formaliser les besoins fonctionnels.
La phase de conception est le cœur de son expertise. Le consultant traduit les besoins métier recueillis en spécifications fonctionnelles détaillées, qui décrivent précisément le comportement attendu du système : règles de gestion, workflows, interfaces, états de sortie, droits d'accès. Il réalise l'analyse des écarts (gap analysis) entre les besoins exprimés et les fonctionnalités standard de la solution retenue, et propose des solutions de paramétrage ou de développement spécifique pour combler ces écarts.
Le paramétrage de la solution représente une phase technique majeure. Le consultant configure les modules de l'ERP ou du CRM selon les spécifications validées : création des structures organisationnelles, définition des flux de données, paramétrage des règles de calcul, conception des rapports et tableaux de bord. Il rédige les cahiers de tests et supervise la recette fonctionnelle, en collaboration avec les utilisateurs clés, pour valider que la solution répond bien aux besoins exprimés.
La conduite du changement et la formation constituent la dernière phase, souvent la plus déterminante pour le succès du projet. Le consultant prépare les supports de formation, anime les sessions de formation auprès des utilisateurs finaux et les accompagne durant les premières semaines de mise en production (phase d'hypercare). Il assure ensuite le support fonctionnel de niveau 2 et 3, en résolvant les incidents et en proposant des évolutions fonctionnelles au fil de la montée en maturité des utilisateurs.